ARTIGO DA SEMANA

Continuous ethanol production from cassava through simultaneous saccharification and fermentation by self-flocculating yeast Saccharomyces cerevisiae CHFY0321.


Choi GW, Kang HW, Moon SK, Chung BW.

Changhae Institute of Cassava and Ethanol Research, Changhae Ethanol Co., Ltd., Palbok-Dong 829, Dukjin-Gu, Jeonju 561-203, Korea. changrd@chethanol.com

Abstract

In this study, a fermentor consisting of four linked stirred towers that can be used for simultaneous saccharification and fermentation (SSF) and for the accumulation of cell mass was applied to the continuous production of ethanol using cassava as the starchy material. For the continuous process with SSF, the pretreated cassava liquor and saccharification enzyme at total sugar concentrations of 175 g/L and 195 g/L were continuously fed to the fermentor with dilution rates of 0.014, 0.021, 0.031, 0.042, and 0.05 h(-1). Considering the maximum saccharification time, the highest volumetric productivity and ethanol yield were observed at a dilution rate of 0.042 h(-1). At dilution rates in the range of 0.014 h(-1) to 0.042 h(-1), high production rates were observed, and the yeast in the first to fourth fermentor showed long-term stability for 2 months with good performance. Under the optimal culture conditions with a feed sugar concentration of 195 g/L and dilution rate of 0.042 h(-1), the ethanol volumetric productivity and ethanol yield were 3.58 g/L x h and 86.2%, respectively. The cell concentrations in the first to fourth stirred tower fermentors were 74.3, 71.5, 71.2, and 70.1 g dry cell/L, respectively. The self-flocculating yeast, Saccharomyces cerevisiae CHFY0321, developed by our group showed excellent fermentation results under continuous ethanol production.

Link: http://www.springerlink.com/content/c747k383873hrt80/

OPORTUNIDADE - BIOMM Technology (antiga Biobrás)

A Biomm está trabalhando no projeto “Desenvolvimento de processo para a obtenção industrial de misturas enzimáticas celulolíticas destinadas à produção de biocombustíveis a partir de biomassa”


Temos duas bolsas aprovadas pelo CNPq/RHAE para iniciarmos o mais breve possível.

As bolsas são as seguintes:

Bolsa SCE categoria 6 nível B

- Duração da bolsa: 24 meses.
- Perfil do bolsista: Engenheiro químico ou engenheiro em biotecnologia com mestrado em fermentação ou área afim.
- Valor: R$ 2200,00

Bolsa SCE categoria 3 nível B
- Duração da bolsa: 24 meses.
- Perfil do bolsista: Biólogo, engenheiro químico ou engenheiro em biotecnologia com Doutorado em Microbiologia ou área afim.
- Valor: R$ 3000,00

Os interessados podem enviar o currículo para rh2000@uai.com.br
A RH2000 é a empresa responsável pelo processo de seleção.

OPORTUNIDADE - Bolsa de Pós Doutorado

Vagas para bolsa tipo pós-doc na Universidade de Brasília e EMBRAPA/CENARGEN. Bolsa da Capes, valor R$3.300,00.


Interessados entrar em contato com:
Profa Dra Sonia Maria de Freitas (nina@unb.br), ou Prof Dr Luciano Paulino da Silva (lucianopaulinosilva@gmail.com) ou Prof Dr. Marcelo Porto BemQuerer (mpbemque@cenargen.embrapa.br).

Área de interesse: Nanotecnologia

Tópicos de interesse:

1) Desenvolvimento de sistemas nanoestruturados voltados para a liberação controlada de compostos orgânicos voláteis e não voláteis e de biomoléculas
2) Avaliação das propriedades físico-químicas, estruturais e biológicas de subprodutos agroindustriais
3) Produção de nanoestruturas poliméricas
4) Estratégias de imobilização de enzimas e desenvolvimento de nanocatalisadores
5) Encapsulamento e liberação controlada de biomoléculas

ARTIGO - A célula sintética de Craig Venter

Prezados,

Este artigo é um marco na biotecnologia moderna. E como um marco, não pode ficar de fora da nossa divulgação científica.

Prof. Alexsandro

Research Articles - SCIENCE



Creation of a Bacterial Cell Controlled by a Chemically Synthesized Genome
Daniel G. Gibson,1 John I. Glass,1 Carole Lartigue,1 Vladimir N. Noskov,1 Ray-Yuan Chuang,1 Mikkel A. Algire,1 Gwynedd A. Benders,2 Michael G. Montague,1 Li Ma,1 Monzia M. Moodie,1 Chuck Merryman,1 Sanjay Vashee,1 Radha Krishnakumar,1 Nacyra Assad-Garcia,1 Cynthia Andrews-Pfannkoch,1 Evgeniya A. Denisova,1 Lei Young,1 Zhi-Qing Qi,1 Thomas H. Segall-Shapiro,1 Christopher H. Calvey,1 Prashanth P. Parmar,1 Clyde A. Hutchison, III,2 Hamilton O. Smith,2 J. Craig Venter1,2,*
 
Link: http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/science.1190719

REVIEW DA SEMANA - Nanotecnologia

Magnetic drug delivery and targeting: principles and applications.

Babincova M, Babinec P.

Department of Nuclear Physics and Biophysics, Faculty of Mathematics, Physics, and Informatics, Comenius University, Mlynska dolina F1, Bratislava, Slovakia. babincova@fmph.uniba.sk
Abstract
BACKGROUND: Nanomaterials are at the leading edge of the rapidly developing field of nanotechnology. Magnetic nanoparticles for cancer therapy and diagnosis have been developed on the basis of their unique physico-chemical properties not present in other materials. Their versatility is widely exploited in such diverse techniques as cell and macromolecule separation and purification, immunoassays, targeted drug delivery, controlled material release, electromagnetic hyperthermia, gene therapy, or magnetic resonance imaging. In this review we concentrate on the physical principles of magnetic drug targeting and biomedical applications of this technique. METHODS AND RESULTS: We examined several databases, PubMed, ISI Web of Knowledge, and Scopus, for the period 1985-2009, with specific attention to studies that used targeting of magnetic nanoparticles especially in the therapy and diagnostics of tumors. We have also presented several of our own results on theoretical simulations of magnetic particle motion in external magnetic field. CONCLUSIONS: We found growing number of published papers in this field of nanomedicine, showing the almost unlimited potential of magnetic nanoparticles in the field of experimental and clinical oncology.

link: http://publib.upol.cz/~obd/fulltext/Biomed/2009/4/243.pdf

ARTIGO DA SEMANA - Biotecnologia Aplicada a Saúde

Comparison of recombinant Trypanosoma cruzi peptide mixtures versus multiepitope chimeric proteins as sensitizing antigens for immunodiagnosis

Clin Vaccine Immunol. 2009 Jun;16(6):899-905. Epub 2009 Apr 1.

Abstract
The aim of this work was to determine the best strategy to display antigens (Ags) on immunochemical devices to improve test selectivity and sensitivity. We comparatively evaluated five Trypanosoma cruzi antigenic recombinant peptides, chose the three more sensitive ones, built up chimeras bearing these selected Ags, and systematically compared by enzyme-linked immunosorbent assay the performance of the assortments of those peptides with that of the multiepitope constructions bearing all those peptides lineally fused. The better-performing Ags that were compared included peptides homologous to the previously described T. cruzi flagellar repetitive Ag (here named RP1), shed acute-phase Ag (RP2), B13 (RP5), and the chimeric recombinant proteins CP1 and CP2, bearing repetitions of RP1-RP2 and RP1-RP2-RP5, respectively. The diagnostic performances of these Ags were assessed for discrimination efficiency by the formula +OD/cutoff value (where +OD is the mean optical density value of the positive serum samples tested), in comparison with each other either alone, in mixtures, or as peptide-fused chimeras and with total parasite homogenate (TPH). The discrimination efficiency values obtained for CP1 and CP2 were 25% and 52% higher, respectively, than those of their individual-Ag mixtures. CP2 was the only Ag that showed enhanced discrimination efficiency between Chagas' disease-positive and -negative samples, compared with TPH. This study highlights the convenience of performing immunochemical assays using hybrid, single-molecule, chimeric Ags instead of peptide mixtures. CP2 preliminary tests rendered 98.6% sensitivity when evaluated with a 141-Chagas' disease-positive serum sample panel and 99.4% specificity when assessed with a 164-Chagas' disease-negative serum sample panel containing 15 samples from individuals infected with Leishmania spp.

link: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2691048/pdf/0005-09.pdf

II 4BIOTEC - 2 a 5 de AGOSTO de 2010

2 a 5 de Agosto de 2010

 - Biotecnologia Vegetal
 - Biotecnologia Animal
 - Biotecnologia Industrial
 - Biotecnologia Aplicada a Saúde
 - Biocombustíveis
 - Produção de Fármacos

Local: Anfiteatro Bento Prado Jr.
           Universidade Federal de São Carlos (UFSCar)
           Rod. Washington Luis, km 235
           São - Carlos - SP

Inscrições: www.ufscar.br/4biotec
de 07 a 31/06/2010
Informações:
Rodrigo Malimpensa
Tel: (16) 3351-8377
E-mail: rmalimpensa@ufscar.br

ATUALIZAÇÕES - CONGRESSOS INTERNACIONAIS

Apesar do nosso maior objetivo seja divulgar a biotecnologia "made in Brasil", acho que também é importante divulgar o que está acontecendo na área de biotec no mundo.

Congressos e Eventos INTERNACIONAIS

Congreso Iberoamericano de Biotecnologia
Rueda Internacional de Bionegocios

1 a 4 de septiembre de 2010
Recinto del Pensamiento, Manizales, Colombia
endereço: http://www.bioredandina.com/

IBS 2010 - 14th Internacional Biotechnology Symposium and Exhibition
Biotechnology for the Sustainability of Human Society
14-18 September 2010 . Rimini - Italy.
endereço: http://www.ibs2010.org/


Obs: Após 1 (uma) semana este anúncio ficará disponível no link "CONGRESSOS" do blog.

O que faz um bom cientista?

Prezados leitores,

Nesses dias, lí uma matéria divulgada pelo Herton Escobar que, acredito eu, seja reporter vinculado ao jornal Estadão, e achei muito interessante divulgá-la aqui. Como ele mesmo disse na matéria, "Hoje vou fugir um pouco do formato básico deste blog" em prol de um assunto muito importante: O que faz um bom cientista? Gostaria de pedir permissão para aqueles estudantes, professores, pesquisadores apaixonados pelas divulgações em biotecnologia para que me concedam este espaço. Dessa reportagem podemos tirar muito proveito. Talvez ela sirva de lição para todos da comunidade acadêmica que, muitas vezes, esquecem do seu papel dentro da sociedade ou para aqueles cientistas que acham que o que fazem é mais importante do que o trabalho dos outros. Enfim, que essa reportagem divulgada pelo Herton Escobar sirva para todos nós.

prof. Alexsandro


Por Herton Escobar

Hoje vou fugir um pouco do formato básico deste blog para fazer uma reflexão
editorial sobre um tema que foi levantado esta semana em meio às chamas que
destruíram a coleção de cobras e aranhas do Instituto Butantan (IB).
Em entrevistas à imprensa, o ex-diretor da Fundação Butantan (braço privado
do IB, que faz a gestão financeira do instituto) , Isaias Raw, defendeu a
priorização da produção de vacinas no Instituto e menosprezou as pesquisas
feitas com a coleção. Disse que a função do IB era salvar vidas e não “ficar
brincando com cobra” e que a ciência feita pelos pesquisadores da coleção
era de “quinta categoria”.

Logo, vieram me perguntar: “Mas e aí, os caras lá são bons mesmo?”

Essa pergunta é extremamente difícil de ser respondida. Em geral, quem tem
um bom conhecimento de ciência olha para um cientista e sabe se ele é bom ou
não é. Mas como é que você “prova” isso estatisticamente? Sem conhecer
nenhum dos pesquisadores do Butantan pessoalmente, como é que você definiria
se eles são cientistas de primeira, segunda ou terceira categoria?

Ironicamente, definir um bom cientista cientificamente não é nada fácil.
Seja qual for o parâmetro escolhido, alguém sempre acaba injustiçado. Tanto
que a definição de mérito para distribuição de bolsas e seleção de projetos
é um dos temas mais polêmicos da política científica – não só no Brasil, mas
no mundo todo.

Por exemplo: Quem é o melhor cientista, aquele que publica mais, aquele que
ensina mais, aquele que patenteia mais, aquele que faz pouca pesquisa mas
atrai muitos recursos (financeiros e humanos) para sua instituição….?

E se considerarmos apenas as publicações, quem é o melhor: aquele que
publicou 10 trabalhos medianos em 1 ano, ou aquele que publicou 1 trabalho
revolucionário em 10 anos? Aquele que só publicou trabalhos medianos
certamente não vai ganhar o Prêmio Nobel, mas talvez ele tenha orientado e
formado muito mais alunos do que aquele que fez uma descoberta bombástica no
mesmo período. E aí? Quem é o melhor cientista? Quem merece ganhar mais
dinheiro e ter ar-condicionado na sala?

A resposta “correta”, claro, é que precisamos de todos os tipos de
cientistas. Precisamos de pesquisadores audaciosos, empreendedores, do tipo
Craig Venter, que buscam descobertas revolucionárias e não perdem tempo com
“picuinhas”. Precisamos de pesquisadores- professores inteligentes, que se
dediquem a formar jovens cientistas competentes e fazer boas pesquisas, sem
se preocupar necessariamente em ganhar um Prêmio Nobel. Precisamos também de
bons cientistas curadores, educadores, expositores, oradores, escritores,
divulgadores, que talvez nunca publicaram um trabalho de impacto, mas que
sabem transmitir o conhecimento da ciência para o grande público de maneira
inteligente, seja na forma de um livro ou de uma exposição, fazendo com que
as pessoas entendam, apoiem e se entusiasmem pela ciência. Etc.

Aos olhos de alguém como o Dr. Isaias, que dedicou sua vida ao estudo e à
produção de vacinas, o trabalho de alguém que dedica a vida a descrever
espécies de cobra guardadas em vidros com álcool pode parecer totalmente
irrelevante. Mas obviamente que não é. Claro que a importância da produção
de vacinas é inegável, inquestionável, mas as milhares de pessoas que
visitam o Instituto Butantan todos os meses não vão lá para olhar as
fábricas de vacinas. Vão lá para ver as cobras e aprender sobre elas! Ou
alguém aí já viu uma criança com a cara grudada no vidro e a boca aberta de
espanto olhando pela janela de uma fábrica? “Mamãe, olha só aquela linha de
produção, que incrível!!! Tira uma foto?”…. acho que não.

Pois então: é só graças a essas coleções biológicas e graças ao trabalho
desses cientistas “de quinta categoria” que conhecemos os nomes, os hábitats
e o comportamento de todas essas cobras e aranhas fascinantes. Que graça
teria viver cheio de saúde num mundo sobre o qual não conhecemos nada?

Ciência não precisa salvar vidas nem ganhar Prêmio Nobel para ser boa. Só
precisa ser boa.

Review - Lacases

Trends Biotechnol. 2010 Feb;28(2):63-72

Designer laccases: a vogue for high-potential fungal enzymes?

Rodgers CJ, Blanford CF, Giddens SR, Skamnioti P, Armstrong FA, Gurr SJ.

Department of Chemistry, South Parks Road, University of Oxford, Oxford OX13QR, UK.

Abstract
Laccases are blue multicopper oxidases that catalyse the four-electron reduction of O(2) to water coupled with the oxidation of small organic substrates. Secreted basidiomycete white-rot fungal laccases orchestrate this with high thermodynamic efficiency, making these enzymes excellent candidates for exploitation as industrial oxidants. However, these fungi are less tractable genetically than the ascomycetes, which predominantly produce lower-potential laccases. We address the state-of-play regarding expression of high reduction potential laccases in heterologous hosts, and issues regarding enzyme glycosylation status. We describe the synergistic role of structural biology, particularly in unmasking structure-function relationships following genetic modification and their collective impact on laccase yields. Such recent research draws closer the prospect of industrial quantities of designer, fit-for-purpose laccases. 2009 Elsevier Ltd.
Link para download:
http://www.sciencedirect.com/science?_ob=MImg&_imagekey=B6TCW-4XVPFR0-1-8&_cdi=5181&_user=687355&_pii=S0167779909002145&_orig=search&_coverDate=02%2F28%2F2010&_sk=999719997&view=c&wchp=dGLbVzb-zSkWA&md5=626c329397f0fbd1c1a8fe131bd6be20&ie=/sdarticle.pdf

Artigo - Expressão hereróloga de anticorpos

Biotechnol Bioeng. 2010 Apr 22

Antibody expression kinetics in glycoengineered Pichia pastoris.


Potgieter TI, Kersey SD, Mallem MR, Nylen AC, d'Anjou M.

Bioprocess Research and Development, Merck & Co, 126 E. Lincoln Avenue, Rahway, New Jersey, 07065; telephone: +1 732 594 1474; fax: +1 732 594 6510.

Abstract

Growth of the antibody market has fueled the development of alternative expression systems such as glycoengineered yeast. Although intact antibody expression levels in excess of 1 g L(-1) have been demonstrated in glycoengineered yeast, this is still significantly below the titers reported for antibody fragments in fungal expression systems. This study presents a simplified approach to estimate antibody secretion kinetics and oxygen uptake rate requirements as a function of growth-rate controlled by a limiting methanol feed rate in glycoengineered Pichia pastoris. The yield of biomass from methanol and the specific oxygen requirements predicted in this study compare well with values reported in the literature for wild-type P. pastoris, indicating the intrinsic nature of these yields independent of glycoengineering or the heterologous protein expressed. Specific productivity was found to be a non-linear function of specific growth rate. Based on comparison with relationships between specific growth rate and specific productivity reported in the literature this correlation seems empirical in nature and cannot be established a priori. These correlations were then used in a simple mass balance based model to predict the cultivation performance of carbon limited cultivations under oxygen transfer limited conditions to indicate the usefulness of this approach to predict large scale performance and aid in process development. Biotechnol. Bioeng. (c) 2010 Wiley Periodicals, Inc.

link para download: http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/fulltext/123370342/PDFSTART